La conception d'une expérience n'est pas une activité courante pour les élèves et c'est pourtant une étape presque obligée de la démarche d'investigation en sciences expérimentales. Lorsqu'elle est formalisée, elle aboutit à la production d'un protocole écrit, objet scientifique très peu décrit bien qu'il soit central dans le processus expérimental. L'étude de fascicules de TP au niveau Lycée et universitaire montre que le protocole expérimental apparaît de manière complexe dans les TP, suggérant que c'est un objet peu identifiable pour les élèves. Le besoin d'outils pour la recherche et pour l'enseignement nous a amenés à construire un modèle fonctionnel du protocole expérimental que nous présentons ici. Il comporte deux parties, un arbre de tâches qui rend compte de la nature structurée et opérationnelle d'un protocole, et une liste organisée de propriétés permettant, entre autre, l'évaluation d'un protocole.