Recherche - Université Grenoble Alpes

Document
9
Notice
1

article de synthèse
1

2024
1
2023
3
2022
1
2020
2
2019
2
2018
1

anglais
8
indéterminé
2

Génomique évolutive des Microbes | Microbial Evolutionary Genomics
10
Translational Innovation in Medicine and Complexity | Recherche Translationnelle et Innovation en Médecine et Complexité - UMR 5525
5
Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB
4
Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525
3
Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications Grenoble - UMR 5525
2
Centre interdisciplinaire de recherche en biologie
1
Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires - UMR5100
1

		MacSyFinder v2: Improved modelling and search engine to identify molecular systems in genomes Bertrand Néron , Rémi Denise , Charles Coluzzi , Marie Touchon , Eduardo P.C. Rocha , et al. Peer Community Journal, 2023, 3, pp.e28. ⟨10.24072/pcjournal.250⟩ Article dans une revue pasteur-04060331v2	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager More
		Identification of Protein Secretion Systems in Bacterial Genomes Using MacSyFinder. Sophie S. Abby , Eduardo P C Rocha Methods in Molecular Biology, 2018, Bacterial protein secretion systems, 1615, pp.1-21. ⟨10.1007/978-1-4939-7033-9_1⟩ Article dans une revue hal-01677379v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager More
		Identifying Conjugative Plasmids and Integrative Conjugative Elements with CONJscan Jean Cury , Sophie S. Abby , Olivia Doppelt-Azeroual , Bertrand Néron , Eduardo P C Rocha Fernando de la Cruz. Horizontal Gene Transfer : Methods and Protocols, Springer Science; Business Media, pp.265-283, 2019, 978-1-4939-9876-0. ⟨10.1007/978-1-4939-9877-7_19⟩ Chapitre d'ouvrage pasteur-02867882v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager More
		MacSyFinder Bertrand Néron , Sophie Abby , Eduardo Rocha 2023, ⟨swh:1:dir:b7595ff8d8bfbb327f63ae0dc8f33314f46c0996;origin=https://github.com/gem-pasteur/macsyfinder;visit=swh:1:snp:d01ecf21ed904146f244bad043bf052f2d2f8d0d;anchor=swh:1:rev:1821de180b026abe24043305cbfbdcf5e63d2881⟩ Logiciel hal-04372564v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager More
		MacSyFinder v2: An improved search engine to model and identify molecular systems in genomes Bertrand Néron , Rémi Denise , Charles Coluzzi , Marie Touchon , Eduardo Rocha , et al. JOBIM, Jul 2022, Rennes (Campus de Beaulieu), France. , https://jobim2022.sciencesconf.org/data/pages/JOBIM2022_proceedings_posters_demos.pdf Poster de conférence pasteur-04583571v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager More
		The evolution of protein secretion systems by co-option and tinkering of cellular machineries Rémi Denise , Sophie S. Abby , Eduardo Rocha Trends in Microbiology, 2020, 28 (5), pp.372-386. ⟨10.1016/j.tim.2020.01.005⟩ Article dans une revue pasteur-02626815v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager More
		macsyfinder Bertrand Néron , Sophie Abby , Eduardo Rocha 2024, ⟨swh:1:dir:1e9ecd3b3b2bff278fac4b2814c56380c01853c9;origin=https://github.com/gem-pasteur/macsyfinder;visit=swh:1:snp:673748faa3f4f15687e2b6eb6d3d30b9eee9e68c;anchor=swh:1:rel:91c37f034f0348980547f788953425c0e490b8ea⟩ Logiciel hal-04668349v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager More
		Diversification of the type IV filament superfamily into machines for adhesion, protein secretion, DNA uptake, and motility Rémi Denise , Sophie S. Abby , Eduardo P. C. Rocha PLoS Biology, 2019, 17 (7), pp.e3000390. ⟨10.1371/journal.pbio.3000390⟩ Article dans une revue pasteur-02263349v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager More
		Intracellular Positioning Systems Limit the Entropic Eviction of Secondary Replicons Toward the Nucleoid Edges in Bacterial Cells Julie Dauverd -Girault , Charlène Planchenault , Marine C Pons , Caroline Schiavon , Patricia Siguier , et al. Journal of Molecular Biology, 2020, 432 (3), pp.745-761. ⟨10.1016/j.jmb.2019.11.027⟩ Article dans une revue hal-02392007v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager More
		Identification of protein secretion systems in bacterial genomes using MacSyFinder version 2 Sophie S. Abby , Rémi Denise , Eduardo Pc Rocha 2023 Pré-publication, Document de travail hal-04257010v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager More

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MacSyFinder v2: Improved modelling and search engine to identify molecular systems in genomes

Identification of Protein Secretion Systems in Bacterial Genomes Using MacSyFinder.

Identifying Conjugative Plasmids and Integrative Conjugative Elements with CONJscan

MacSyFinder

MacSyFinder v2: An improved search engine to model and identify molecular systems in genomes

The evolution of protein secretion systems by co-option and tinkering of cellular machineries

macsyfinder

Diversification of the type IV filament superfamily into machines for adhesion, protein secretion, DNA uptake, and motility

Intracellular Positioning Systems Limit the Entropic Eviction of Secondary Replicons Toward the Nucleoid Edges in Bacterial Cells

Identification of protein secretion systems in bacterial genomes using MacSyFinder version 2