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Article Dans Une Revue Natural Product Reports Année : 2021

New developments in RiPP discovery, enzymology and engineering

New developments in RiPP discovery, enzymology and engineering.

Manuel Montalbán-López
  • Fonction : Auteur
Thomas Scott
  • Fonction : Auteur
Sangeetha Ramesh
  • Fonction : Auteur
Imran Rahman
  • Fonction : Auteur
Auke van Heel
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Jakob Viel
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Vahe Bandarian
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Elke Dittmann
  • Fonction : Auteur
Olga Genilloud
  • Fonction : Auteur
Yuki Goto
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María José Grande Burgos
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Colin Hill
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Seokhee Kim
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Jesko Koehnke
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John Latham
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a James Link
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Beatriz Martínez
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Satish Nair
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Yvain Nicolet
Sylvie Rebuffat
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  • PersonId : 830880
Hans-Georg Sahl
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Dipti Sareen
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Eric Schmidt
Lutz Schmitt
  • Fonction : Auteur
Konstantin Severinov
Roderich Süssmuth
Andrew Truman
Huan Wang
Jing-Ke Weng
  • Fonction : Auteur
Gilles van Wezel
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Qi Zhang
  • Fonction : Auteur
Jin Zhong
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Jörn Piel
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Douglas Mitchell
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Oscar Kuipers
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Wilfred van Der Donk
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A. James Link
  • Fonction : Auteur

Résumé

Covering: up to June 2020Ribosomally-synthesized and post-translationally modified peptides (RiPPs) are a large group of natural products. A community-driven review in 2013 described the emerging commonalities in the biosynthesis of RiPPs and the opportunities they offered for bioengineering and genome mining. Since then, the field has seen tremendous advances in understanding of the mechanisms by which nature assembles these compounds, in engineering their biosynthetic machinery for a wide range of applications, and in the discovery of entirely new RiPP families using bioinformatic tools developed specifically for this compound class. The First International Conference on RiPPs was held in 2019, and the meeting participants assembled the current review describing new developments since 2013. The review discusses the new classes of RiPPs that have been discovered, the advances in our understanding of the installation of both primary and secondary post-translational modifications, and the mechanisms by which the enzymes recognize the leader peptides in their substrates. In addition, genome mining tools used for RiPP discovery are discussed as well as various strategies for RiPP engineering. An outlook section presents directions for future research.

Dates et versions

hal-02947402 , version 1 (24-09-2020)

Identifiants

Citer

Manuel Montalbán-López, Thomas Scott, Sangeetha Ramesh, Imran Rahman, Auke van Heel, et al.. New developments in RiPP discovery, enzymology and engineering. Natural Product Reports, 2021, ⟨10.1039/d0np00027b⟩. ⟨hal-02947402⟩
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