Développements méthodologiques en biocristallographie : Diffusion anomale et complexes de lanthanides Biophysique sous hautes pressions
Résumé
Depuis le début de ma thèse en 1998, mon activité de recherche s’est orientée vers des développements méthodologiques en cristallographie des macromolécules biologiques. Ces développements s’articulent autour de deux thématiques qui sont l’utilisation de complexes de lanthanide pour la détermination des structures à travers les méthodes mettant en oeuvre la diffusion anomale et l’utilisation des hautes pressions hydrostatiques.
Je fais ici le choix d’expliquer l’historique de mon cheminement en espérant que cela puisse servir à un étudiant qui lira ce manuscrit, car ce cheminement illustre ce qu’est la recherche fondamentale, sans idée préconçue d’une quelconque application industrielle ou sociétale à
court ou moyen terme, mais en étant vigilant à la possibilité qu’elle puisse conduire à une application.
Après un stage de Maîtrise (Master1) effectué au CEA de Grenoble qui m’a permis de (re)découvrir le monde des protéines, puisque l’étude portait sur la simulation de spectre RPE d’une catalase, j’ai suivi le DEA national de Cristallographie et RMN Biologique, formation qui a malheureusement disparu avec la mise en place du système LMD. Mon sujet de stage de DEA (Master2) portait sur le développement de la méthode MASC, pour Multi-wavelength
Anomalous Solvent Contrast (Fourme et al., 1995; Ramin et al., 1999; Shepard et al., 2000).
D’un point de vue théorique, cette méthode met à profit une variation de contraste obtenue en modifiant le signal anomal d’un agent de contraste (un diffuseur anomal) aléatoirement dispersé dans le solvant d’un cristal. La variation du signal anomal, et donc la variation de
contraste, sont obtenues par variation de l’énergie du faisceau incident au voisinage de l’un des seuils d’absorption du diffuseur anomal. Cette variation de contraste fournit de l’information à basse résolution sur la macromolécule composant le cristal en permettant en principe d’obtenir son enveloppe.
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