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v1
Article dans une revue
Valentina Baldazzi
,
Delphine Ropers
,
Johannes Geiselmann
,
Daniel Kahn
,
Hidde De Jong
.
Importance of metabolic coupling for the dynamics of gene expression following a diauxic shift in Escherichia coli
Journal of Theoretical Biology
, Elsevier, 2012, 295, pp.100-115.
<http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022519311005728>
.
<10.1016/j.jtbi.2011.11.010>
inria-00593109
v1
Rapport
Valentina Baldazzi
,
Delphine Ropers
,
Johannes Geiselmann
,
Daniel Kahn
,
Hidde De Jong
.
Importance of metabolic coupling for the dynamics of gene expression following a diauxic shift in E. coli
[Research Report] RR-7617, INRIA. 2011
hal-00793037
v1
Communication dans un congrès
Valentina Baldazzi
,
Delphine Ropers
,
Hans Geiselmann
,
Daniel Kahn
,
Hidde Jong
.
Importance of metabolic coupling for the dynamics of gene expression following a diauxic shift in E. coli
Proceedings of the 18th IFAC World Congress
, 2011, Milan, Italy. pp.14851-14856, 2011
hal-00793038
v1
Chapitre d'ouvrage
Valentina Baldazzi
,
Pedro T. Monteiro
,
Michel Page
,
Delphine Ropers
,
Hans Geiselmann
et al.
Qualitative analysis of genetic regulatory networks in bacteria
W. Dubitzky and J. Southgate and H. Fuss.
Understanding the Dynamics of Biological Systems: Lessons Learned from Integrative Systems Biology
, Springer, pp.111-130, 2011, 978-1-4419-7964-3.
<10.1007/978-1-4419-7964-3_6>
hal-00793014
v1
Communication dans un congrès
Delphine Ropers
,
Valentina Baldazzi
,
Hidde Jong
.
Reduction of a kinetic model of the carbon starvation response in Escherichia coli
Proceedings of the 15th IFAC Symposium on System Identification, SYSID 2009
, 2009, Saint Malo, France. IEEE, 2009
hal-00793021
v1
Communication dans un congrès
Valentina Baldazzi
,
Delphine Ropers
,
Yves Markowicz
,
Daniel Kahn
,
Hans Geiselmann
et al.
The carbon assimilation network in Escherichia coli is densely connected and largely sign-determined by directions of metabolic fluxes
Actes des Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2010)
, 2010, Montpellier, France. pp.11-12, 2010
inria-00527140
v1
Article dans une revue
Valentina Baldazzi
,
Delphine Ropers
,
Yves Markowicz
,
Daniel Kahn
,
Johannes Geiselmann
et al.
The carbon assimilation network in Escherichia coli is densely connected and largely sign-determined by directions of metabolic fluxes.
PLoS Computational Biology
, Public Library of Science, 2010, 6 (6), pp.e1000812.
<http://www.ploscompbiol.org/article/info:doi/10.1371/journal.pcbi.1000812>
.
<10.1371/journal.pcbi.1000812>
hal-00762615
v1
Article dans une revue
Valentina Baldazzi
,
Nadia Bertin
,
Hidde De Jong
,
M. Génard
.
Towards multiscale plant models: integrating cellular networks
Trends in Plant Science
, Elsevier, 2012, 17 (12), pp.728-736.
<http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1360138512001513>
.
<10.1016/j.tplants.2012.06.012>
hal-00793034
v1
Article dans une revue
Delphine Ropers
,
Valentina Baldazzi
,
Hidde Jong
.
Model reduction using piecewise-linear approximations preserves dynamic properties of the carbon starvation response in Escherichia coli
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 8, pp.166-181.
<10.1109/TCBB.2009.49>
hal-00784447
v1
Article dans une revue
Valentina Baldazzi
,
Paola Paci
,
Massimo Bernaschi
,
Filippo Castiglione
.
Modeling lymphocyte homing and encounters in lymph nodes
BMC Bioinformatics
, BioMed Central, 2009, 10 (1), pp.387.
<10.1186/1471-2105-10-387>
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