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	hal-00762570v1 Article dans une revue Valentina Baldazzi, Delphine Ropers, Johannes Geiselmann, Daniel Kahn, Hidde De Jong. Importance of metabolic coupling for the dynamics of gene expression following a diauxic shift in Escherichia coli Journal of Theoretical Biology, Elsevier, 2012, 295, pp.100-115. <http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022519311005728>. <10.1016/j.jtbi.2011.11.010>
	inria-00593109v1 Rapport Valentina Baldazzi, Delphine Ropers, Johannes Geiselmann, Daniel Kahn, Hidde De Jong. Importance of metabolic coupling for the dynamics of gene expression following a diauxic shift in E. coli [Research Report] RR-7617, INRIA. 2011
	hal-00762122v1 Chapitre d'ouvrage Grégory Batt, Bruno Besson, Pierre-Emmanuel Ciron, Hidde De Jong, Estelle Dumas et al. Genetic Network Analyzer: A Tool for the Qualitative Modeling and Simulation of Bacterial Regulatory Networks Jacques van Helden, Ariane Toussaint, Denis Thieffry. Bacterial Molecular Networks Methods and Protocols, 804, Springer, pp.439-462, 2012, Methods in Molecular Biology,, 978-1-61779-361-5. <10.1007/978-1-61779-361-5_22>
	hal-01420729v1 Article dans une revue Hidde De Jong, Johannes Geiselmann, Delphine Ropers. Resource reallocation in bacteria by reengineering the gene expression machinery Trends in Microbiology, Elsevier, 2017
	hal-01103556v1 Article dans une revue Andreas Kremling, Johannes Geiselmann, Delphine Ropers, Hidde De Jong. Understanding carbon catabolite repression in Escherichia coli using quantitative models Trends in Microbiology, Elsevier, 2015, 23 (2), pp.99-109. <10.1016/j.tim.2014.11.002>
	inria-00070641v1 Rapport Grégory Batt, Hidde De Jong, Johannes Geiselmann, Michel Page, Delphine Ropers et al. Symbolic Reachability Analysis of Genetic Regulatory Networks using Qualitative Abstraction [Research Report] RR-5362, INRIA. 2004, pp.37
	inria-00133991v2 Rapport Grégory Batt, Delphine Ropers, Hidde De Jong, Michel Page, Johannes Geiselmann. Symbolic Reachability Analysis of Genetic Regulatory Networks using Qualitative Abstractions [Research Report] RR-6136, INRIA. 2007
	hal-01079299v1 Communication dans un congrès Nils Giordano, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé, Johannes Geiselmann, Hidde De Jong. Dynamic optimisation of resource allocation in microorganisms 21st International Symposium on Mathematical Theory of Networks and Systems (MTNS 2014), Jul 2014, Groningen, Netherlands. <https://fwn06.housing.rug.nl/mtns2014/>
	inria-00070594v1 Rapport Delphine Ropers, Hidde De Jong, Michel Page, Dominique Schneider, Johannes Geiselmann. Qualitative Simulation of the Nutritional Stress Response in Escherichia coli [Research Report] RR-5412, INRIA. 2004, pp.39
	inria-00072061v1 Rapport Hidde De jong, Johannes Geiselmann, Grégory Batt, Céline Hernandez, Michel Page. Qualitative Simulation of the Initiation of Sporulation in B. subtilis [Research Report] RR-4527, INRIA. 2002
	hal-01178203v1 Article dans une revue Hidde De Jong, Delphine Ropers, Radu Mateescu, Johannes Geiselmann. De la cellule à la puce Les Cahiers de l'INRIA - La Recherche, INRIA, 2008, 419, pp.I-II
	hal-00926635v1 Chapitre d'ouvrage Johannes Geiselmann. Systems biology and metabolic engineering in bacteria Miguel A. Aon and Valdur Saks and Uwe Schlattner. Systems Biology of Metabolic and Signaling Networks : Energy, Mass and Information Transfer, 16, Springer, pp.351-367, 2014, Springer Series in Biophysics, <10.1007/978-3-642-38505-6_13>
	hal-01247997v1 Communication dans un congrès Hidde De Jong, Johannes Geiselmann. Fluorescent reporter genes and the analysis of bacterial regulatory networks Oded Maler; Adam Halász; Thao Dang; Carla Piazza. Hybrid Systems Biology: Proceedings of the Second International Workshop, HSB 2013, and Third International Workshop, HSB 2014, 2015, Vienna, Austria. Springer-Verlag, 7699, pp.1-24, 2015, Lecture Notes in Bioinformatics. <http://www.springer.com/fr/book/9783319276557>. <10.1007/978-3-319-27656-4_2>
	hal-00784438v1 Article dans une revue Hidde De Jong, Caroline Ranquet, Delphine Ropers, Corinne Pinel, Johannes Geiselmann. Experimental and computational validation of models of fluorescent and luminescent reporter genes in bacteria. BMC Systems Biology, BioMed Central, 2010, 4 (1), pp.55. <10.1186/1752-0509-4-55>
	inria-00072181v1 Rapport Hidde De Jong, Jean-Luc Gouzé, Céline Hernandez, Tewfik Sari, Michel Page et al. Qualitative Simulation of Genetic Regulatory Networks Using Piecewise-Linear Models [Research Report] RR-4407, INRIA. 2002
	hal-00857345v1 Article dans une revue Guillaume Baptist, Corinne Pinel, Caroline Ranquet, Jérôme Izard, Delphine Ropers et al. A genome-wide screen for identifying all regulators of a target gene Nucleic Acids Research, Oxford University Press (OUP): Policy C - Option B, 2013, 41 (17), pp.e164. <http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2013/07/26/nar.gkt655.full>. <10.1093/nar/gkt655>
	hal-01097632v1 Article dans une revue Diana Stefan, Corinne Pinel, Stephane Pinhal, Eugenio Cinquemani, Johannes Geiselmann et al. Inference of quantitative models of bacterial promoters from time-series reporter gene data PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2015, 11 (1), pp.e1004028. <10.1371/journal.pcbi.1004028>
	hal-01332394v1 Article dans une revue Nils Giordano, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé, Johannes Geiselmann, Hidde De Jong. Dynamical allocation of cellular resources as an optimal control problem: Novel insights into microbial growth strategies PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2016, 12 (3), pp.e1004802. <10.1371/journal.pcbi.1004802>
	inria-00527140v1 Article dans une revue Valentina Baldazzi, Delphine Ropers, Yves Markowicz, Daniel Kahn, Johannes Geiselmann et al. The carbon assimilation network in Escherichia coli is densely connected and largely sign-determined by directions of metabolic fluxes. PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2010, 6 (6), pp.e1000812. <http://www.ploscompbiol.org/article/info:doi/10.1371/journal.pcbi.1000812>. <10.1371/journal.pcbi.1000812>
	hal-01217828v1 Article dans une revue Clelia Peano, Johannes Wolf, Julien Demol, Elio Rossi, Luca Petiti et al. Characterization of the Escherichia coli σ(S) core regulon by Chromatin Immunoprecipitation-sequencing (ChIP-seq) analysis Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2015, 5, pp.10469. <10.1038/srep10469>
	hal-01247993v1 Article dans une revue Jérôme Izard, Cindy Gomez-Balderas, Delphine Ropers, Stephan Lacour, Xiaohu Song et al. A synthetic growth switch based on controlled expression of RNA polymerase Molecular Systems Biology, EMBO Press, 2015, 11 (11), pp.840. <http://msb.embopress.org/content/11/11/840>
	hal-00793352v1 Article dans une revue Sara Berthoumieux, Hidde De Jong, Guillaume Baptist, Corinne Pinel, Caroline Ranquet et al. Shared control of gene expression in bacteria by transcription factors and global physiology of the cell Molecular Systems Biology, EMBO Press, 2013, 9 (1), pp.634. <10.1038/msb.2012.70>
	hal-01067524v1 Article dans une revue Uyen Hoang Phuong Nguyen, Denys Grekov, Johannes Geiselmann, Valérie Stambouli, Marianne Weidenhaupt et al. Anodic deposit from respiration metabolic pathway of Escherichia coli Electrochimica Acta, Elsevier, 2014, 130, pp.200-205. <10.1016/j.electacta.2014.03.019>
	hal-00319485v1 Article dans une revue Grégory Batt, Hidde De Jong, Michel Page, Johannes Geiselmann. Symbolic reachability analysis of genetic regulatory networks using discrete abstractions Automatica, Elsevier, 2008, 44 (4), pp.982-989
	hal-00857366v1 Article dans une revue Omaya Dudin, Stéphan Lacour, Johannes Geiselmann. Expression dynamics of RpoS/Crl-dependent genes in Escherichia coli Research in Microbiology, Elsevier, 2013, 164 (8), pp.838-847. <http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0923250813001319>. <10.1016/j.resmic.2013.07.002>
	hal-01217800v1 Article dans une revue Valentin Zulkower, Michel Page, Delphine Ropers, Johannes Geiselmann, Hidde De Jong. Robust reconstruction of gene expression profiles from reporter gene data using linear inversion Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2015, 31 (12), pp.i71-i79. <10.1093/bioinformatics/btv246>
	hal-00171939v1 Article dans une revue Delphine Ropers, Hidde De Jong, Johannes Geiselmann, Radu Mateescu, Michel Page et al. Validation of qualitative models of genetic regulatory networks by model checking: analysis of the nutritional stress response in Escherichia coli. Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2005, 21 Suppl 1, pp.i19-28. <10.1093/bioinformatics/bti1048>
	hal-00562237v1 Article dans une revue Frédéric Boyer, Bruno Besson, Guillaume Baptist, Jérôme Izard, Corinne Pinel et al. WellReader: a MATLAB program for the analysis of fluorescence and luminescence reporter gene data. Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2010, 26 (9), pp.1262-3. <10.1093/bioinformatics/btq016>
	hal-00173847v1 Article dans une revue Hidde De Jong, Johannes Geiselmann, Grégory Batt, Céline Hernandez, Michel Page. Qualitative simulation of the initiation of sporulation in Bacillus subtilis. Bulletin of Mathematical Biology, Springer Verlag, 2004, 66 (2), pp.261-99. <10.1016/j.bulm.2003.08.009>
	hal-00173849v1 Article dans une revue Hidde De Jong, Jean-Luc Gouzé, Céline Hernandez, Michel Page, Tewfik Sari et al. Qualitative simulation of genetic regulatory networks using piecewise-linear models. Bulletin of Mathematical Biology, Springer Verlag, 2004, 66 (2), pp.301-40. <10.1016/j.bulm.2003.08.010>
	1 2	Pertinence Auteur A→Z Auteur Z→A Titre A→Z Titre Z→A Date de publication croissante Date de publication décroissante Date de dépôt croissante Date de dépôt décroissante 30 résultats par page 50 résultats par page 100 résultats par page Pour les 31 documents Exporter XML-TEI BibTeX EndNote CSV PDF Export avancé... Syndication RSS ATOM

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